Die Anfänge der Protestanten in Lyon ist lang und verbunden mit dem Wandel der Stadt selbst. Im 16. Zeitalter erlebte Lyon eine Blüte des Calvinismus, wobei zahlreiche Händler und intellektuelle Persönlichkeiten sich dem neuen Bekenntnis zuwandten. Diese anfängliche Präsenz führte zu einer dynamischen reformierten Gemeinschaft, die jedoch au